西南印度洋超慢速扩增洋中脊（SWIR）在全球热液系统中起着举足轻重的作用，是目前热液研究的热点，同时也是地球科学研究的焦点之一。本研究提取了SWIR热液羽流样品的DNA，分别构建古菌、细菌16SrDNA克隆文库，通过RCR分析与序列测定，分析微生物的群落结构与环境相关性。结果表明，样品中的细菌全部为变形杆菌（Proteobacteria）和拟杆菌（Bacteroidetes），其中黄杆菌（Flavobacteria）为优势种群，N,t-proteobacteria具有较高的多样性，另外还有少量的a-proteobacteria、β-proteobacteria。样品中的古菌序列绝大多数（82％）属于泉古菌（Cren—archaeota），主要与MaringGroupI具有亲密的亲缘关系，此外还存在硫化叶菌（Thermoprotei）、热变形菌（Thermo-proteales）以及MaringGroupII。系统发育分析表明：西南印度洋洋中脊热液羽流中具有丰富多样的微生物群落。