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人或动物等宿主肠道内定植有大量微生物。但是，宿主肠道内微生物的多样性和演替一直被认为是人和动物营养研究中的黑箱（black box）。经过科学家几个世纪的研究已证实：正常微生物群是一个新的人体生理学系统；肠道微生物菌群参与宿主对营养素的消化、吸收与合成；刺激其免疫机制。近年又发现：微生物群影响宿主基因表达，可进行微生物与宿主之间的“分子对话”，例如：一个人肥胖或者苗条的倾向可能部分是由生活在肠道中的微生物群体的组成所决定的（戈登，2005）。可见，肠道微生物是未来微生态科学极其重要的研究领域。对于肠道微生