【摘 要】
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目的采用GEO芯片联合网络药理学的研究方法,初步探讨当归饮子治疗慢性荨麻疹（CU）的crosstalk及miRNA-mRNA机制,为后续实验研究提供理论基础。方法采用R语言limma包对GSE57178芯片进行差异分析;采用TCMSP、TCMID、PubChem、String、DAVID、TargetScan数据库对当归饮子有效成分、潜在靶点、PPI、KEGG、cross-talk及miRNA-m
【基金项目】
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“十三五”国家重点研发计划中医药现代化研究重点专项“针灸优势病种疗效评价国际合作研究”项目（2017YFC1703605）； 国家中医药管理局湖湘五经配伍针推学术流派传承工作室项目（LP0118041-Z1）； 湖南省中医药管理局重点项目（201423）； 国家重点基础研究发展计划（973计划）（
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目的采用GEO芯片联合网络药理学的研究方法,初步探讨当归饮子治疗慢性荨麻疹（CU）的crosstalk及miRNA-mRNA机制,为后续实验研究提供理论基础。方法采用R语言limma包对GSE57178芯片进行差异分析;采用TCMSP、TCMID、PubChem、String、DAVID、TargetScan数据库对当归饮子有效成分、潜在靶点、PPI、KEGG、cross-talk及miRNA-mRNA机制进行预测分析。结果 GSE57178差异分析得出257个差异基因,其中240个基因表达上调（如:HIF1A、MMP12、STAT3等）;有17个基因表达下调（如:FABP7、KRT15、LGR5等）,其中有36个当归饮子治疗慢性荨麻疹的潜在靶点,拓扑分析出24个关键靶点基因在其中发挥重要作用;cross-talk分析得出1个靶点（SELE）在TNF通路与细胞粘附分子（CAMs） 2条通路中"串话";1个靶点（ITGB2）在吞噬体与CAMs 2条通路中"串话";2个靶点（CTSL、CTSS）在抗原处理表达、吞噬体与溶酶体3条通路中"串话";2个靶点（VCAM1、ICAM1）在NF-kappa B、TNF与CAMs 3条通路中"串话";1个靶点（TLR4）在HIF-1、NF-kappa B、吞噬体3条通路中"串话";miRNA-mRNA预测分析得出24个潜在靶点mRNA,构成了477组miRNA-mRNA模式,在CU炎症反应中发挥作用。结论本研究从基因、分子角度预测和分析了当归饮子治疗CU的多靶点、多cross-talk、多miRNA-mRNA作用机制,为后续研究提供了依据,可成为未来机制研究的新方向。
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