目的对处于不同病程的百日咳病例,开展细菌培养、血清抗体和聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)等检测方法,对比分析其临床诊断的价值与意义。方法 2010~2012年,通过社区百日咳症状主动监测和医院被动监测两种模式,采用细菌培养、PCR和血清抗体检测[单份血抗百日咳毒素(Antibody to Pertussis Toxin,Anti-PT)-免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig)G、IgM和双份血清IgG≥4倍增高]等方法,对百日咳监测病例开展检测。按照百日咳流行病学调查表的内容,对确诊病例的基本信息、就诊信息和临床症状开展流行病学调查。结果共确诊百日咳400例,单份血标本采集率为72.5%,Anti-PT-IgG阳性率为57.93%,病程中位数(Median,M)为21d,四分位间距(Interval of Quartiles,IQR)为15~30d;IgM的阳性率为17.59%,M为6d,IQR为5~16d,两种抗体检测结果的一致率为51.38%。双份血清IgG≥4倍增高采集率为2.5%,阳性率为90%。鼻咽拭子采集率91%,PCR检测阳性率为58.24%;鼻咽抽取液采集率为18.25%,阳性率为69.86%,两种采集方法检测阳性率差异无统计学意义[Fisher’s Exact Test(费希尔精确检验)P=0.18]。PCR阳性病例的病程M为10d,IQR为7~18d,两种采样方法检测的一致率为80.82%。260例百日咳确诊病例同时采集了鼻咽拭子和血标本,其中Anti-PT-IgG阳性率为58.46%,鼻咽拭子PCR阳性率为50.76%,两种采样方法检测的一致率为20%。结论百日咳病例的实验室检测方法应考虑病程因素,单份血Anti-PT-IgG检测适合于中晚期病程的病例,鼻咽拭子PCR适合于早期病程的病例,两种方法有较好的互补性。