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通过对鲤科鱼类30个个体所代表的18个种的随机扩增，作者得到了大量有系统发育信息的DNA多态片段。通过Rapdplot程序将DNA的多态片段转换成遗传距离（d=1－S，S＝2NxNy／Nx＋Ny）。该遗传距离的矩阵经PHYLIP软件包中的Neighbor（option=NJ）程序处理后，生成了低等鲤科鱼类代表属种的分支系统图。从该系统图可以看出：RAPD分析方法在鲤科鱼类的系统发育研究中有一定的局限性，它比较适合于亚科内属间系统发育的研究。结果显示亚科并不是一个单元类群，其中的马口鱼类和细鲫类各自形成单元群，但这两个类群间的关系并不直接联系。在分析结果中，分布于东亚的雅罗鱼亚科鱼类比亚科鱼类更原始。