【摘 要】
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目的:探讨藤黄健骨片治疗骨关节炎的作用机制.方法:通过检索中药系统药理学数据库(TCMSP)获取藤黄健骨片的活性成分和作用靶点,并运用UniProt数据库对靶点信息进一步规范,再通过Cytoscape 3.7.2软件构建中药-成分-靶点(基因)网络;利用GeneCards数据库、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、TTD数据库和DrugBank数据库检索OA疾病相关靶点,利用在线作图工具Venny获得藤黄健骨片与OA的共同靶点;运用String构建蛋白相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape 3.7.
【机 构】
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中国中医科学院眼科医院 北京 100040
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目的:探讨藤黄健骨片治疗骨关节炎的作用机制.方法:通过检索中药系统药理学数据库(TCMSP)获取藤黄健骨片的活性成分和作用靶点,并运用UniProt数据库对靶点信息进一步规范,再通过Cytoscape 3.7.2软件构建中药-成分-靶点(基因)网络;利用GeneCards数据库、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、TTD数据库和DrugBank数据库检索OA疾病相关靶点,利用在线作图工具Venny获得藤黄健骨片与OA的共同靶点;运用String构建蛋白相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape 3.7.2软件对关键靶蛋白进行筛选;并在Metascape平台进行基因本体(GO)功能富集分析以及基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测其生物过程及作用通路;通过分子对接计算最低结合能,并对结果可视化.结果:经过筛选去重得到藤黄健骨片活性成分85种,药物作用靶点251个,OA疾病靶点1015个,利用Venny取交集得到药物—疾病共同靶点117个;GO富集分析显示这些靶点涉及对有毒物质的反应、对无机物的反应、对脂多糖的反应、细胞对有机环状化合物的反应等生物学过程,KEGG富集分析显示共同靶点的通路包括癌症的途径、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、IL-17信号通路等;分子对接显示PTGS2与木犀草素、β-谷甾醇的最低结合能最低,均为-9.3kcal· mol-1.结论:藤黄健骨片中的槲皮素、木犀草素、山奈酚和β-谷甾醇等很可能通过IL-6、TP53、TNF和PTGS2等靶点作用于IL-17信号通路、HIF-1信号通路、JAK-STAT信号通路,从而发挥治疗骨关节炎(osteoarthritis,OA)的作用.
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