蛋白质结构样板库的构建及其总体特征

来源 :内蒙古大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shichun
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按照分辨率较高、同一性较低的标准,从PDB库中选取高质量的蛋白质空间结构数据,构建了精度高于0.25nm、序列同一性低于25%的样板数据库SLCTBASE,其中有效残基数近19万。建库过程中,对PDB原始数据文件进行了详细检验,发现其中包含有错误及可疑数据。本文还统计了SLCTBASE中主链键长、CA-CA距离、二面角的分布情况。
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