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浮游病毒是指游离在水体中的各类病毒,被认为是水体微生物群落中的重要成分。浮游病毒在微食物环、生物地球化学循环、群落结构及多样性等方面起着重要作用。浮游病毒的遗传多样性极其丰富,如何对其进行检测和分析是近几年国际上的研究热点。本文综述了浮游病毒主要类群藻病毒、噬藻体和噬菌体的遗传多样性;分析了宿主、水层、季节等对浮游病毒遗传多样性的影响;介绍了浮游病毒遗传多样性研究中常用的DNA聚合酶基因、结构蛋白基因等靶标基因及PFGE、RFLP、DGGE、DNA微阵列和宏基因组等分子生物学分析技术。