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李先闻，1902年10月10日出生在重庆市江津县（原四川省江津县）一个小农家庭。1915年，在其叔父哲夫的鼓励下，考取四川省保送生名额，进人北京清华预备学校读书。当时在校高班同学赵连芳组织的新农社，引发了他学农的志趣。1923年，李先闻从清华获得学士后，赴美国印第安那州普度大学园艺系求学。1926年，获得硕士学位，随即进入康乃尔大学研究生院，师从国际著名的玉米遗传学大师埃默森（R．A．Emerson），重点攻读遗传学专业。