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目的:通过生物信息分析手段探讨四妙勇安汤对动脉粥样硬化(AS)与血栓闭塞性脉管炎(TAO)“异病同治”的潜在分子机制.方法:通过数据库挖掘与检索获取四妙勇安汤中4味中药的活性化合物和对应的靶标;通过GeneCards、比较基因组数据库(CTD)以及美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库筛选AS和TAO的关联靶点;运用Venny 2.1,获得药物作用于二病的共有靶点;基于STRING数据库构建共有靶蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;通过Cytoscape 3.7.2软件构建药物-活性化合物-共有靶点-疾病整体调控网络图.使用Bioconductor生物信息软件包进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果:四妙勇安汤与AS、TAO的共有靶点主要为VEGFA、IL6、JUN、TNF、FOS、MAPK8、MMP9、IL10、ICAM1等计47个;筛选出以黄酮类和甾醇类为主的有效活性成分计9个;KEGG通路富集得到的这些靶点共同参与糖尿病并发症AGE-RAGE、TNF、动脉粥样硬化与流体剪切应力、人巨细胞病毒感染、细胞凋亡、T细胞受体等多条通路调节.结论:四妙勇安汤通过抗炎、减少斑块形成、免疫反应、改变血液流变等多条生物学通路发挥药理作用,证实了其多成分、多靶点、多途径的调节特点,预测了四妙勇安汤“异病同治”AS与TAO的潜在分子机制,为实验设计和后续研究提供理论依据.