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半胱氨酸蛋白酶（Cysteine protease，CP）是一类在酶的活性中心含有半胱氨酸残基的蛋白水解酶。CP属于木瓜蛋白酶家族，广泛分布于从病毒至脊椎动物的生物体中。对人体半胱氨酸蛋白酶的研究主要集中在细胞凋亡分子机制和恶性肿瘤的基因诊断与治疗等方面。而对寄生虫半胱氨酸蛋白酶研究的内容则更为广泛，其中包含半胱氨酸蛋白酶在寄生虫免疫逃避、毒力、组织细胞入侵、蜕皮及包囊形成、孵化等作用的研究。研究发现，该酶具有较好的种特异性，既可作为寄生虫病诊断抗原和疫苗候选分子，同时，也是药物治疗寄生虫病的靶标。因此，