【摘 要】
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目的了解四环素类耐药基因在不同国家人体、动物和环境微生态中的分布情况及其多样性。方法利用生物信息学方法,对2 036份不同来源的微生态样本宏基因组测序数据进行四环素耐
【机 构】
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中国疾病预防控制中心传染病预防控制所生物信息室传染病预防控制国家重点实验室,感染性疾病诊治协同创新中心
【基金项目】
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“生物安全关键技术研发”重点专项(2018YFC1200100);国家自然科学基金(81700016);国家科技重大专项(2018ZX10305410、2018ZX10712001、2018ZX10733402)
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目的了解四环素类耐药基因在不同国家人体、动物和环境微生态中的分布情况及其多样性。方法利用生物信息学方法,对2 036份不同来源的微生态样本宏基因组测序数据进行四环素耐药基因的鉴定,研究四环素耐药基因在不同来源、不同国别、不同人体部位的分布及耐药机制。结果2 036份样本中,四环素耐药基因检出率为44.70%(910份),其中人源样本检出率最高,达78.99%(880/1 114),其次是动物样本,检出率40.98%(25/61)。共检出28种四环素耐药基因,248份样本至少检出10种以上四环素耐药基因,在
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