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种子纠纷是指种子购买者和种子使用者在购买种子、使用种子过程中,与种子经营者之间就其双方的权益和责任问题而发生的争议。造成农业损失的原因是多方面的,除假劣种子外,品种适应性、抗逆性(不抗高温、不抗低温、不耐渍、不耐旱、不抗病、不抗虫等)、短斤少两、广告宣传、经营承诺、政府强制干预、种子包衣、转基因种子、不当栽培措施、标签内容不规范、品种缺陷未告知、病虫害、气候原因、人为因素(肥害、药害)等都会引起种子纠纷。