基于连锁不平衡水稻源库相关性状的关联分析

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为挖掘水稻源库相关性状优异等位基因,利用分布于12条染色体的6 704个SNP标记与来自31个国家和地区的261份籼稻核心种质资源的剑叶长、剑叶宽、剑叶叶面积、倒2叶长、倒2叶宽、倒2叶叶面积、每穗粒数、千粒重、单株产量共9个源库相关性状进行群体结构、连锁不平衡状况和全基因组关联分析。结果表明,261份籼稻核心种质资源的9个源库相关性状的变异系数介于12.46%-26.21%,表型变异丰富。群体结构显示261份籼稻核心种质资源的最适亚群数为3。LD分析表明,SNP位点之间存在着一定程度的连锁不平衡,在显著
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