【摘 要】
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MYB基因家族作为高等植物最大的一类转录因子家族,调节植物的生长发育及代谢.到目前为止,针对番木瓜MYB转录因子家族的研究仍相对较少.本研究基于番木瓜转录组测序数据,筛选
【机 构】
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岭南师范学院生命科学与技术学院,湛江,524048
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MYB基因家族作为高等植物最大的一类转录因子家族,调节植物的生长发育及代谢.到目前为止,针对番木瓜MYB转录因子家族的研究仍相对较少.本研究基于番木瓜转录组测序数据,筛选出34个在番木瓜果实成熟过程中表达显著差异的MYB类转录因子基因,并对其蛋白序列进行理化性质、亚细胞定位和系统进化等生物信息学分析.本研究依据MYB保守域的个数将34个番木瓜MYB类转录因子分为1R-MYB和R2R3-MYB两类.上述MYB基因编码蛋白的氨基酸数目在141～1 709个之间,其分子量分布在16 312.94～186 299.92Da范围内,皆为不稳定的亲水性蛋白.上述34个蛋白均不含信号肽,绝大部分以t-螺旋与无规卷曲为主要的二级结构元件.亚细胞定位分析表明,番木瓜MYB蛋白主要分布在细胞核.进化树分析显示番木瓜MYB蛋白与拟南芥MYB蛋白可被分为三个亚类,即亚类聚类Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ,推测聚在同一个亚类上的转录因子可能具有相似的功能.研究结果为进一步探究MYB家族的基因功能提供了基础数据,也为其他物种MYB转录因子的研究分析提供一定的帮助.
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