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目的分析草杆菌二联活菌胶囊治疗慢性急性腹泻的疗效及安全性。方法以我院2011年5月~2014年5月收治的160例急性腹泻和慢性腹泻患者作为研究对象，急性腹泻和慢性腹泻患者各80例，急慢性腹泻组患者平均分为观察组和对照组，对照组患者接受双歧三联活菌肠溶胶囊治疗，观察组患者接受枯草杆菌二联活菌胶囊治疗，比较两组患者的效果、腹泻缓解时间和并发症几率。结果急性腹泻组和慢性腹泻组的观察组和对照组患者的疗效、腹泻缓解时间和并发症人数都无显著差异，差异无统计学意义（>0.05）。结论枯草杆菌二联活菌胶囊治疗急慢性腹泻的疗效显著，副作用小，安全性能高，值得临床应用和推广。