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中枢神经系统的免疫“特免状态”和血脑屏障都是相对不完整的。在特定条件下，血脑屏障的通透性发生改变，具有免疫效应的淋巴细胞可以通过血脑屏障。脑内血管周间隙具有类似淋巴管道的作用。脑内多种细胞具有抗原提呈作用。中枢神经系统神经元退行性变过程中表达主要组织相容性复合物分子、黏附分子和补体受体，并产生多种细胞因子，从而引发脑内免疫炎症。