猪生殖-呼吸道综合征病毒(PRRSV)CH-la株N基因的分子克隆、序列测定及其比较分析

来源 :中国畜禽传染病 | 被引量 : 0次 | 上传用户:banban0802
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根据已发表的PRRSVIAF-exp91株的核酸序列,设计了一对特异性引物,用RT-PCR扩增了PRRSVCH-la株的N基因,经补平和磷酸化后,克隆到pUC18SmaI位点上。经电泳分析、酶切和PCR鉴定证实后,进行序列测定。序列分析表明CH-la株与IAF-exp91株(美洲型)N基因核苷酸同一性为93.2%,氨基酸同一性高达96.7%,而与LV株(欧洲株)核苷酸同一性为63%,氨基酸同一性仅为59%。其推导氨基酸残基分子量为13.3kDa。根据CH-la株N基因推导的氨基酸残基缺少欧洲型毒株LV特有的两个氨基酸片段,表明CH-1a株与IAF-exp91株同源性高于它与LV株的同源性,而且CH-1a株与鼠乳糖脱氢酶增高症病毒(LDV)在进化关系上比LV株与LDV更密切。CH-1a株N基因推导的氨基酸残基N-端1/2段约26%是由Arg、Lys和His这3种氨基酸组成的,其疏水性侧像图与LV株和VR-2332株(美洲型)几乎相同,这表明两种基因型的核衣壳蛋白(N蛋白)具有一定的保守性。由于N蛋白是PRRSV所有结构蛋白中免疫原性比较强的病毒蛋白,是现行血清学试验的抗原基础,因此N基因的分子克隆为研制PRR?
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