【摘 要】
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针对目前实验方法识别天然无序蛋白质中的功能模体耗时费力、难度大,而传统计算机辅助识别方法过于依赖人工挑选特征且准确度低等问题,提出一种利用深度卷积神经网络预测功能
【机 构】
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山东理工大学计算机科学与技术学院,山东大学山东省软件工程重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金项目（61602280,61473179）, 山东省自然科学基金项目（ZR2014FQ028）
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针对目前实验方法识别天然无序蛋白质中的功能模体耗时费力、难度大,而传统计算机辅助识别方法过于依赖人工挑选特征且准确度低等问题,提出一种利用深度卷积神经网络预测功能模体位置的方法;该方法直接将蛋白质序列作为输入,通过计算对应的位置特异性打分矩阵和3组氨基酸指数特征,将序列映射到数值矩阵中,模型自行抽取特征并自动识别功能模体的隐性序列模式来进行预测。结果表明：当使用相同数据集进行训练和测试时,本文中提出的方法的性能明显优于其他传统的识别算法,在验证集上的感受性曲线下的面积（AUC）值达到0.708,在测试集上
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