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辣椒Trihelix转录因子家族的生物信息学分析

来源 :中国农学通报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：plumblossommeihua

【摘 要】

：

Trihelix转录因子在调控植物生长发育以及响应逆境胁迫等多方面发挥着重要作用,属于一个小家族。通过系统地阐述辣椒Trihelix转录因子家族成员特征和进化关系,进一步为研究辣

【作 者】

：

张春利 袁岐 赵婷婷 许向阳 

【机 构】

：

东北农业大学园艺园林学院,东北农业大学农业部东北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室

【出 处】

：

中国农学通报

【发表日期】

：

2017年17期

【关键词】

：

辣椒 Trihelix 转录因子 进化 生物信息学分析 pepper Trihelix transcription factor evolution bioin 

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Trihelix转录因子在调控植物生长发育以及响应逆境胁迫等多方面发挥着重要作用,属于一个小家族。通过系统地阐述辣椒Trihelix转录因子家族成员特征和进化关系,进一步为研究辣椒Trihelix转录因子的生物学功能提供理论基础。本研究在辣椒基因组范围内,通过HMMER 3.0软件鉴定Trihelix基因家族成员,应用CDD验证其蛋白的功能结构域;采用MEGA5.2软件进行系统进化树分析;利用MEME和Map Inspect工具对其蛋白序列进行基序和染色体定位分析。利用功能已知的拟南芥Trihelix蛋白

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