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在1999年—2003年5年中，西南地区部署了下列水工环地质太调查工作：(1)西南岩溶石山地区地下水勘查与生态环境地质调查；(2)西南红层找水勘查示范；(3)西藏“一江两河”地区干旱县地下水资源调查；(4)长江上游生态环境地质调查；(5)长江上游主要环境地质问题调查；(6)四川省、云南省、贵州省、重庆市和西藏自治区1：50万环境地质调查；(7)云南省、四川省矿山环境地质调查与评估；