动态规划算法对GenoCAD设计结果的优化(英文)

来源 :生物信息学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liuyu80237029
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
Geno CAD(www.genocad.com)是一种基于Web的免费合成生物学设计软件,用它可以进行表达载体及人工基因网络设计。持续点击代表各种合成生物学标准"零件"的图标,以一种语法进行设计,最后就可以得到由数十个功能片段组成的复杂质粒载体。但是在GenoCAD中,每一类的合成生物学标准"零件"数量众多。随着这些标准"零件"的不断开发,其数量也在进一步增加,目前选择合适的"零件"组装成功能性的质粒载体费时费力并且容易发生错误。在进行载体设计的最后阶段,从众多的"零件"中选择合适的往往比较困难。
其他文献
Tan-Tracker碳卫星资料联合数据同化系统是针对即将发射的中国的碳卫星TANSat,并基于先进数据同化算法PODEn4DVar,同时采用了联合数据同化的策略,紧扣碳卫星资料同化的这一国际前沿开发的面向科研和应用的碳卫星资料同化系统。本文设计运行了Tan-Tracker碳卫星资料联合数据同化系统同化GOSAT卫星CO_2浓度观测的真实同化实验,并评估了Tan-Tracker碳同化系统的可行性和
期刊
本文分析了Epson L1800打印机不同色彩控制方式的颜色输出效果。利用色彩管理工具,针对打印机驱动中的不同色彩调整设置条件,建立了体现其颜色输出特性的ICC特性文件;利用ICC特性文件,分析了不同色彩调整设置下颜色输出的色域大小和阶调层次特性。结果表明,其Adobe RGB伽马1.8、Adobe RGB伽马2.2和无色彩调整三种颜色设置对应的色域相对较大,但因其色料呈色方式并不能达到Adobe
期刊
针对小波变换图像分解的方向有限性,利用Contourlet变换的更精细分解性能,提出隐马尔可夫树模型的图像压缩方法。该方法节点状态不仅与父节点的状态直接相关,同时也相邻节点的状态有联系,可以获得更好的Contourlet变换系数,避免小波变换的局限性,最后与其它图像压缩方法进行了对比实验。结果表明,本文方法不仅可以有效对图像进行压缩,图像视觉效果更优,而且有效提高计算速度并节省存储空间,峰值信噪比
期刊
本文引入正规Ω-集合范畴的概念,研究了正规Ω-集合范畴中的幂对象,进而说明正规Ω-集合范畴是cartesian闭的。
期刊
定义了weakly r-clean环.环R叫做weakly r-clean环,如果对于任意一个元素x∈R可以写成x=r+e或x=r-e的形式,其中r∈Reg(R)且e∈Id(R).首先,证明了在什么情况下weakly r-clean环是weakly clean的.然后,得到了weakly r-clean环的一些性质.进而推广了r-clean环的相应结果.
期刊
A polyhedral active set algorithm PASA is developed for solving a nonlinear optimization problem whose feasible set is a polyhedron. Phase one of the algorithm is the gradient projection method, while
期刊
首先给出反软子格的新概念以及两个反软子格分别在限制并和或的运算下仍然是反软子格。其次利用软集的反对偶给出反软子格的等价刻画。再次利用软集的反扩张原理给出反软子格在同态映射下像与原像的性质。最后在全体反软子格组成的集合H上引入链条件并讨论H是阿丁的或诺特的充要条件。
期刊
断层是岩石圈中顺破裂面发生明显位移的一种断裂构造。断面,断盘,断层位移是构成断层的三个几何要素,其中断层位移要素对研究断层的活动性起着重要作用。因此人们为了划分位移量提出了断距、滑距、落差等概念。因此本针对断层的断距、滑距、落差分别从他们的定义与应用范围来辨析他们三者的区别联系。
期刊
碳酸饮料是指在一定条件下充入二氧化碳气体的饮料,不包括由发酵法自身产生的二氧化碳气体。由于碳酸饮料中富含二氧化碳,可在炎热的夏季带走体内热量,起到降温作用。一、科学选购碳酸饮料碳酸饮料分为果汁型、果味型、可乐型和其它型等几大类,国家标准《碳酸饮料(汽水)》(GB/T10792-2008)中规定果汁型碳酸饮料中果汁含量必须大于2.5%,二氧化碳气容量(20℃)不低于1.
期刊
In this paper,the BF theory method is applied to the nonrotating isolated horizons in Lovelock theory.The final entropy matches the Wald entropy formula for this theory.We also confirm the conclusion
期刊