【摘 要】
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目的观察羟基苯甲腈类抑制剂与Cdc25B磷酸酯酶相互作用的结合位点残基。方法利用分子动力学模拟的方法观察羟基苯甲腈类抑制剂A8H、3M8与Cdc25B磷酸酯酶之间的氢键作用和相互
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目的观察羟基苯甲腈类抑制剂与Cdc25B磷酸酯酶相互作用的结合位点残基。方法利用分子动力学模拟的方法观察羟基苯甲腈类抑制剂A8H、3M8与Cdc25B磷酸酯酶之间的氢键作用和相互作用能,确定羟基苯甲腈类抑制剂与Cdc25B磷酸酯酶相互作用的结合位点残基。结果 A8H与Cdc25B结合位点残基Y382、D397、K399、R485、R488、R492形成氢键的概率分别为0、2.00%、0.40%、0.60%、0、0,而3M8与Cdc25B结合位点残基Y382、D397、K399、R485、R488、R492形成氢键的概率分别为11.38%、12.97%、0.80%、4.19%、94.41%、97.21%。D397、L398、C484、R485、R488、M505与A8H形成了较强相互作用(相互作用能数值分别为-2.40、-2.50、-2.30、-3.20、-4.00、-1.80 kcal/mol),Y382、D397、L398、C484、R485、R488、R492、M505与3M8形成了较强相互作用(相互作用能数值分别为-1.90、-5.30、-3.40、-1.00、-5.10、-19.40、-21.60、-1.50 kcal/mol)。结论羟基苯甲腈类抑制剂与Cdc25B磷酸酯酶的结合位点残基为Y382、D397、L398、C484、R485、R488、R492、M505。
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