目的为获取全国医疗机构法定传染病报告率水平,研究制定相应的抽样方法和抽样方案。方法利用2005年以来传染病报告率相关调查资料和传染病网络直报系统的传染病报告信息,根据分层整群多阶段抽样的理论和方法,分别计算总体样本、各层样本量、各阶段样本点数,并对计算结果进行归并,完成抽样框架设计。结果最终确定本次调查的总样本量为1998例,按省级、地市级、县(区)级、乡镇级报告机构进行分层,每层内调查样本分别为270、540、864和324例;各层内分别采用3、4、5、6个阶段确定抽样调查样本点。调查范围覆盖9个省、27个地市、27个县(区)、54个乡镇,每个行政区划内随机调查1所对应级别的传染病报告单位。结论本次调查首次将分层整群多阶段抽样应用到传染病报告率评估工作中。在抽样设计过程中,通过限制样本误差,增加置信度,在保证从调查样本到总体推断的精度同时,也减少了调查过程中的人力、物力和时间投入,大大提高调查效率,为今后开展类似工作提供参考。