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近年来随着二代测序等生物技术的的快速发展，蚊虫基因组学、转录组学、小RNA组学等领域的研究也得到了迅速提升。迄今为止，已有多种重要蚊媒包括冈比亚按蚊、致倦库蚊、埃及伊蚊等的基因组获得解析；不同蚊种的基因组大小差异很大，且与基因组中的重复序列的多少呈正相关；基因组序列为嗅觉相关基因、性别决定基因等蚊虫基因的克隆鉴定提供了便利。转录组研究则给蚊虫基因的功能分析带来了有效手段，吸血蚊虫的分子基础、唾液腺蛋白的分类构成以及滞育的发生机制等都借此取得了突破性发展。小RNA组研究则揭示miRNA和piRNA对蚊虫的卵