我国汉族人群α1基因数目可变串联重复序列分布特征的研究

来源 :中国病理生理杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ysd007
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目的:研究我国汉族人群免疫球蛋白α1基因中3个数目可变串联重复序列(VNTR)多态性分布特征,及其与已报道的高加索人群相比较的特点.方法:从现存数据库中寻找α1基因内的3个VNTR位点,即α1基因3端的hs1,2增强子内的VNTR1、其上游6 Kb的VNTR2和位于α1基因第5外显子的E5VNTR.提取201例广东汉族人基因组DNA,PCR分别扩增含上述3个VNTR位点片段,2%-3%凝胶电泳分带鉴定基因型,并以测序证实.结果:与高加索人群比较我国汉族人群α1基因VNTR1多态性分布特征表现为:C(3次重复)等位基因频率明显升高(10.0% vs 1.0%),A(1次重复)等位基因频率偏低(30.3% vs 36.1%-39.4%),差异显著(x2=72.85,P<0.01).基因型BB占37.8%,AB占32.3%,AA占12%,BC占11.4%,AC占4.5%,CC占2.0%,BC、AC基因型分布频率显著高于高加索人群,而AB型分布频率显著低于高加索人群(x2=73.77,P<0.01).另外两个数据库中报道的VNTR位点(VNTR 2及E5VNTR)在我们所测人群中呈均一分布,PCR产物长度分别为136 bp(VNTR 2)和535bp(E5VNTR).结论:我国汉族人群α1基因VNTR多态性分布与基因组数据库中基于高加索人群的资料不尽相同,其中Iα1 hs1,2 VN-TR1多态性不同于高加索人群,突出表现为C等位基因频率及BC、AC基因型频率显著高于高加索人群.而VNTR2和E5VNTR在被检人群中未见多态性.本研究弥补了现存数据库中缺乏我国汉族人群相应数据的不足,同时为以α1基因为候选基因找寻疾病基因的研究提供了可靠的数据.
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