电子文件以其载体和载体与信息结合方式的特殊性，对传统档案保护理论造成很大的冲击，对电子文件的保护，也开辟了档案保护技术的新领域。
　　
　　1、电子文件载体寿命
　　
　　电子文件的载体材料是磁性物质和光盘，它具有易热胀冷缩、磨损、脱落、粘连、生霉等缺点，直接影响信息再现。磁粉中的磁性氧化物颗粒的剩磁感应强度是记录和再现信息的决定因素，它极易受外磁场影响而导致退磁、消磁等。光盘是利用激光进行信息存取的，目前，光盘常用的记录介质主要有碲、碲合金、硒、碳铝化合物以及一些在激光热效应作用下易产生物化性质变化的材料。这些材料不稳定、易氧化、易与碱溶液发生反应。与纸质档案载体相比，电子文件载体材料的寿命要短得多，一般仅为5～15年。
　　
　　2、电子文件受环境条件的影响
　　
　　2.1　温湿度影响。不适宜的温湿度对磁性载体、光盘和纸张均有影响。电子文件载体受温湿度的影响方式截然不同。在温度过高或过低条件下，聚酯底基易膨胀或收缩变形，光盘载体中使用的塑料、铝和多碳材料会弯曲变形，影响激光束精确定位和数据的读写。
　　2.2　灰尘影响。灰尘对电子文件载体的损坏主要有物理损坏、化学损坏和生物损坏。物理損坏是指污染，划伤磁盘、磁带、光盘表面，造成记录信息的损毁；化学损坏是指灰尘中所含的化学成分会不同程度地引起磁盘、磁带、光盘载体腐蚀、降解等化学作用而毁坏，造成记录信息消失；生物损坏是指灰尘是霉菌孢子的传播者，也是霉菌的培养基、繁殖地，霉菌分泌的酶和有机酸会损坏磁性载体和光盘，使数据丢失。灰尘一旦对电子文件载体造成危害，载体上所记录的信息可能会局部丢失，在计算机系统上便无法读出原始信息，使电子文件失去保存价值。在电子文件形成和使用过程中，要采取严密的防灰尘措施。
　　2.3　外来磁场和机械震动的影响。外来磁场作用于磁性载体，能使磁性涂层的剩磁发生消磁或磁化，造成信号失落或信噪比降低，破坏记录信息，影响读出效果。另外，强烈的机械震动也会影响磁性载体材料中磁分子的排列次序，造成剩磁衰减，从而破坏记录信号。因而，要防止外磁场的影响，如远离强磁场，将磁性载体存放在有抗磁性的框架内或金属盒内，等等，并避免强烈的机械震动。
　　2.4　有害气体和光线的影响。有害气体主要是二氧化硫、硫化氢、二氧化氮和氯气等，具有酸性和氧化性，在一定条件下，腐蚀、破坏磁性载体和光盘，致使盘基、带基老化、变质和磁粉脱落，使电子文件信息丢失。光线能使电子文件载体材料发生光氧化反应，使盘基、带基老化，强度下降。同时，紫外线的能量足以破坏磁性载体的剩磁的稳定性，导致信号衰减，影响磁性记录信息的读写效果。
　　
　　3、电子文件的技术寿命
　　
　　电子文件是通过计算机将信息与载体结合在一起而形成的，必须通过计算机才能识读。一旦技术过时，则载体上的信息就无法读出。技术过时的表现有两个：一是技术革新，使旧的存储技术消失。二是由于商业性的原因，使由单个厂家生产或销售的电子文件设备，由于厂家的破产或改变产品生产而很难找到配套产品。一般说来，大多数电子文件载体的预期寿命都超过了识读它的硬件和软件的技术期限，对于电子文件中数字化信息的长期存取而言，技术过时是比载体损坏更为严重的危害。欧美国家在理论上提出三种解决办法：将阅读电子文件的设备与软件保存到某种技术博物馆中；在纸与缩微胶片上制作拷贝；将电子文件转换为尽可能中性格式的文档。这只能是暂时性办法，随着需保存的电子文件数量的增大，将耗费大量的人力物力。
　　
　　4、电子文件信息保护
　　
　　电子文件的信息与载体是可分离的，使文件信息随时面临着被修改、盗窃，甚至被销毁的危险。
　　目前，保护电子文件信息不被修改、盗窃、删除的技术途径主要有防火墙技术、存取权限控制、数据加密法、数字水印法、数字时间印章法等。其中，数据加密法是指按确定的加密变换方法对未经加密的数据作处理，使其成为难于识读的数据；数字水印法是利用某种技术方法把作者的标志如印鉴、花纹等隐藏于电子文件中，电子文件如被拷贝时，这些标志是不会被拷贝的。这些保证了电子文件信息的唯一属性。数字时间印章法用来确保电子文件信息的真实性和原始性不受损害，若归档的电子文件被修改、删除，该文件生成时在网上登记的时间是无法改变的。然而，保护电子文件信息的技术只能是相对的，因为电子文件的加密和解密技术都在不断地发展。