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黑斑口虾蛄雄性生殖系统由精巢、输精管、交接器及副性腺组成。精巢呈管状，末段较直，向前逐渐弯曲，在第七、八胸节处盘曲成耳状。输精管管壁有一层上皮细胞，但无肌细胞；输精管为精巢顶端延伸，两者管径大小很接近。交接器位于第八胸节基部，为棒状结构，连接端较软，呈膜状，可自由弯曲；游离端较硬，外有甲壳质。1对雄性副性腺位于第4－7胸节间，呈细丝状，左右末端各与同侧的输精管共同平行注入交接器中。末段精巢腔内充满着不同发育阶段的精细胞，从末段精巢向后、中、前段精巢、输精管及交接器，精细胞逐渐趋向成熟。成熟精细胞呈卵圆形，