【摘 要】
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目的:分析预测冠状病毒感染对造血系统影响及潜在干预药物,探索其对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的意义.方法:利用基因表达数据库(GEO),筛选冠状病毒感染相关的全基因组表达数
【机 构】
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解放军医学院,北京100853;解放军总医院第二医学中心血液病科,国家老年疾病临床医学研究中心,北京100853;火箭军特色医学中心药剂科,北京100088;山西省心血管病医院人事科,山西太原0300
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目的:分析预测冠状病毒感染对造血系统影响及潜在干预药物,探索其对新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的意义.方法:利用基因表达数据库(GEO),筛选冠状病毒感染相关的全基因组表达数据,使用R语言包对数据进行差异表达分析及KEGG和GO富集分析.使用STRING在线分析网站进行PPI网络分析,筛选出核心基因.再应用自主研发的表观精准治疗预测平台(EpiMed)进行疾病、药物和关联靶基因的分析.结果:检索到1个符合标准的数据库,来源于SARS冠状病毒,共筛选出差异基因3 606个,其中表达上调2 148个,下调1 458个.GO富集主要与病毒感染、造血调节、细胞趋化、血小板颗粒内容物分泌、免疫活化和急性炎症反应等有关.KEGG富集主要与造血功能、凝血级联反应、急性炎症和免疫反应等相关.蛋白互作网络分析中,筛选得到PTPRC、ICAM1、TIMP1、CXCR5、IL-1B、MYC、CR2、FSTL1、SOX1、COL3A1共10个核心基因.EpiMed平台筛选出具有潜在干预作用的药物,包括糖皮质激素、肿瘤坏死因子α抑制剂、丹参、西罗莫司、甘草、赤芍、泛昔洛韦、环孢素A、鱼腥草、氟伐他汀等.结论:SARS冠状病毒感染可通过改变一系列基因表达影响造血系统,据此筛选出的潜在干预药物对于COVID-19的基础和临床研究具有一定的参考意义.
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