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目前，转基因产品检测主要以核酸为对象，特别是外源重组DNA。靶DNA序列的扩增是转基因产品检测的核心技术，如已经广泛应用的定性、定量PCR技术。随着转基因作物种类的增多、种植范围的扩大，已有方法在某些情况下已不能完全满足检测要求，如高通量多靶标分析。综述了近年来基于核酸水平的检测新技术，并对其未来应用于转基因产品检测进行了分析。