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采用40对SSILP、30对InDel和43对SSR标记对来自斯里兰卡的28份杂草稻和14栽培稻，来自国内外的9份籼型栽培稻、7份粳型栽培稻和4份代表性杂草稻进行遗传多样性分析。SSILP、InDel和SSR标记分别检测到84、6l和213个等位基因，其平均多态性信息含量（PIC）分别为0．257、0．255和0．543。聚类分析显示供试的42份斯里兰卡杂草稻和栽培稻均为籼型。SSILP与InDel标记的相关性很高（r=0．989），而它们与SSR标记相关性较低（0．812和0．808）。结果表明，SSI