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目的以12所研究机构2013年肿瘤学国家自然科学基金结题项目为研究对象,分析国家自然科学基金项目的绩效产出,揭示影响国家自然科学基金绩效产出的因素,为医学机构科研竞争力研究提供参考。方法数据包络分析方法（DEA）。结果 12所研究机构中,综合效率、技术效率和规模效率达到DEA有效的分别有3所、4所和3所,分别占研究机构数量的25%、33.3%和25%;综合效率、技术效率和规模效率的平均值分别为0.844、0.896和0.938。结论2013年,肿瘤学国家自然科学基金项目的绩效产出水平总体较好。但受技术效率