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目的采用叶绿体基因psbA-trnH间隔区序列探讨不同产地何首乌的分子鉴定方法。方法分别提取7省区15个居群116份何首乌样品的总DNA,经PCR扩增psbA-trnH间隔区序列,纯化后测序,采用MEGA 6.06软件对序列进行分析。结果何首乌各居群间的遗传距离为0.001~0.187,最大似然法系统树中何首乌15个居群样品聚为2支。结论何首乌的遗传变异较显著,psbA-trnH序列可作为道地种源德庆种源与其他种源分子鉴定的依据。