【摘 要】
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本研究从谷子基因组水平鉴定出33个SiGATA成员,命名为SiGATA1~SiGATA33。利用生物信息学方法对谷子SiGATA家族的系统发育、基因结构、染色体分布、保守基序、蛋白三级结构和顺式调控元件进行预测和分析。结果表明,33个SiGATA转录因子被划分为3组,不均匀的分布在8条染色体上,多数含有CX2CX18CX2C保守结构域;谷子GATA蛋白与单子叶植物水稻的同源性大于其他两种单子叶植物;蛋白三级结构分析表明,整体结构相似度存在差异,同组进化序列基因的结构相似度较高;顺式作用元件分析表明,SiG
【机 构】
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山西农业大学农学院,太原学院园林科学研究所
【基金项目】
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浙江省植物次生代谢与调控重点实验室开放基金(ZWCSDX-201901),山西省重点研发计划(201803D221012-5),山西省重点研发计划(201703D211002-4-2),山西省深度贫困县科技精准扶贫专项(2019FP-12)。
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本研究从谷子基因组水平鉴定出33个SiGATA成员,命名为SiGATA1~SiGATA33。利用生物信息学方法对谷子SiGATA家族的系统发育、基因结构、染色体分布、保守基序、蛋白三级结构和顺式调控元件进行预测和分析。结果表明,33个SiGATA转录因子被划分为3组,不均匀的分布在8条染色体上,多数含有CX2CX18CX2C保守结构域;谷子GATA蛋白与单子叶植物水稻的同源性大于其他两种单子叶植物;蛋白三级结构分析表明,整体结构相似度存在差异,同组进化序列基因的结构相似度较高;顺式作用元件分析表明,SiG
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