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裂殖壶菌Schizochytrium是目前用于商业化生产DHA的高产菌株之一.研究比对了多种裂殖壶菌可溶性蛋白的提取方法及纯化方式,并对IPG胶条的pH范围、胶条长度等双向电泳条件进行了优化.结果表明,裂殖壶菌可溶性蛋白的制备采用玻璃珠破碎结合TCA/丙酮沉淀的方法,并采用长度为24 cm,pH 3～10的IPG胶条进行等电聚焦效果最佳.并利用此电泳体系初步分析了37℃高温培养对裂殖壶菌可溶性蛋白表达的影响.