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设计了适用于双轴涡扇发动机健康参数估计的平方根UKF滤波算法，解决了线性卡尔曼滤波器估计结果准确性依赖于线性模型精度；常规UKF算法中由于计算误差及噪声信号影响引起误差协方差矩阵负定而导致滤波结果发散等问题．提出了根据测量残差变化改进滤波收敛速度与稳定性的方法．发动机渐变与突变故障模式下仿真结果表明，平方根UKF估计算法收敛速度快，稳定性强，精度高，是一种有效的发动机气路部件健康参数估计与故障诊断方法．