二阶HMM算法改进及在miRNA靶基因预测中的应用

来源 :应用科学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：dai_dx

【摘要】

：

隐马氏模型在语音识别和生物信息学中有重要的应用.本文研究二阶隐马氏模型（HMM2）的基本算法,利用归一化和递推原理,改进模型的前向-后向算法及Baum-Welch训练算法并给予证明,

【作者】

：

高松秦殿刚冯铁男马成荣王翼飞

【机构】

：

上海大学数学系

【出处】

：

应用科学学报

【发表日期】

：

2010年3期

【关键词】

：

二阶隐马氏模型前向-后向算法 Baum-Welch算法 miRNA靶基因 second-order hidden Markov model（HMM2） fo

【基金项目】

：

国家自然科学基金（No.30871341）, 上海市重点学科基金（No.S30104）, 上海市教委重点学科建设项目基金（No.J50101）, 科技部重大科技专项基金（No.2008ZX10002-017 No.2008ZX10002-020 No.2009ZX09103-686）资助

下载到本地 , 更方便阅读

下载此文赞助VIP

声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架

论文部分内容阅读

隐马氏模型在语音识别和生物信息学中有重要的应用.本文研究二阶隐马氏模型（HMM2）的基本算法,利用归一化和递推原理,改进模型的前向-后向算法及Baum-Welch训练算法并给予证明,使得该算法更容易理解和机器实现,并保证数值稳定性.将HMM2应用到miRNA靶基因预测的后期过滤处理中取得了较好的结果.

其他文献

《外国教育研究》计量评价与外国教育研究发展现状分析

文章以《中国期刊全文数据库》为统计源，对1998-2003年《外国教育研究》杂志进行了计量评价，并得出我国外国教育研究文献更新速度快、科研人员使用的外语文献资料数量高于中文

期刊

外国教育研究计量评价教育研究引文统计Studies in Foreign Education measure and evaluate educa

提升我国中药产业国际竞争力对策研究

目前，医疗模式正由单纯的疾病治疗向预防与保健相结合的模式转变，威胁人类健康的疾病也由传染性疾病向影响人类身心的慢性疾病方面转化，对防治身心疾病为主的现代疾病则需更多地

期刊

产业国际竞争力中药疾病治疗人类健康化学药品身心疾病天然药物传染性疾病模式转变医疗模式

试论青岛海景花园大酒店的品牌营销策略

在经历了高速成长期后，作为旅游业“三驾马车”之一的酒店业。面临着越来越激烈的市场竞争，严峻的经营形势引起了酒店管理者对品牌营销策略问题的关注，谁能将良好的品牌形象呈现

期刊

品牌营销策略酒店业青岛花园市场竞争社会公众高速成长期酒店管理者经营形势品牌形象

江苏省连云港市“巾帽园丁明星”——崔维云

崔维云1990年7月毕业于苏州大学政治系，获法学士学位；2005年8月评聘为中学高级教师；从教17年来，成绩卓著。从1999—2005年连续4年担任高三年级政治教学工作，连续4年在高考政治评估

期刊

连云港市明星园丁江苏省高考政治高级教师教学工作高三年级

人力资本、社会资本与西方终身教育

西方社会资本理论的发展打破了传统人力资本对学习型社会的垄断地位，为教育开辟了新的领域。本文通过对西方人力资本、社会资本的理论回顾，对人力资本与社会资本的比较，以及介绍

期刊

社会资本人力资本终身教育social capitalhuman capitallifelong education

国有银行商业化环境及其改善

一、资本市场缺陷和国有银行股份制我国的四大国有银行资本充足率低、资产质量差、盈利能力弱是公认的,同时又面临着金融开放后国际同行的激烈竞争,因此通过股份制改造然后上

期刊

国有银行商业化银行资本充足率国有银行改革外部经营环境公司治理结构股份制改造补充资本金市场缺陷盈利能力激烈竞争金融开放上市融资国有产权综

哲学产业化必要性考量

事实上，哲学是文化产业的一部分，它的产品也是商品。哲学并非高深莫测玄妙无常而不能产业化生产，尤其是通俗哲学产品——如全球市场销量累计超过3000万册的《苏菲的世界》，又如蔡

期刊

产业化生产哲学文化考量经营激励机制文化产业市场销量现实可能性中国传统文化行业发展平台

美国洛杉矶社区学院教师的任用、培训经验与启示

美国洛杉矶社区学院在发展的过程中，在教师的培训方面积累了比较丰富的经验。它们对教师的招聘注重专兼职的结合，评估体系也比较完善，对教师的在职培训能考虑到教师本身的需要。

期刊

美国洛杉矶社区学院教师培训AmericaLos Angelescommunity collegeteacher training

低资源消耗多边类型LDPC码译码器的FPGA实现

以低资源消耗和低功耗应用为基础设计了多边类型低密度奇偶校验码译码器.该译码器采用缓存有效连通校验点计算单元与变量点计算单元.分析和实验表明,与传统的部分并行译码器

期刊

多边类型低密度奇偶校验码译码器缓存现场可编程逻辑阵列multi-edge-type low density parity check codes

企业必须重视伴随结果带来的环境问题

一、前育企业在实现经营目标这个目的结果的同时,必定会出现伴随结果.伴随结果与目的结果不同,它并不是人们所期待的,且还有负面效应.因此,了解伴随结果的危害性,掌握伴随结

期刊

企业管理伴随结果环境问题经营理念企业社会责任环境污染环境保护

二阶HMM算法改进及在miRNA靶基因预测中的应用

与本文相关的学术论文