【摘 要】
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目的通过生物信息学的方法分析胰腺癌发生的潜在机制。方法利用GEOquery分析差异基因表达,利用clusterProfiler进行富集分析。利用STRING数据库进行蛋白相互作用分析。通过TC
【机 构】
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中国医科大学附属盛京医院第二肿瘤内科,中国医科大学附属盛京医院普通外科
【基金项目】
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辽宁省自然科学基金(20170541001)
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目的通过生物信息学的方法分析胰腺癌发生的潜在机制。方法利用GEOquery分析差异基因表达,利用clusterProfiler进行富集分析。利用STRING数据库进行蛋白相互作用分析。通过TCGA数据库对核心基因进行预后分析。结果通过差异分析得到277个差异基因。通过富集分析发现,低表达基因主要和胆固醇代谢过程、酒精代谢过程以及消化有关,高表达基因主要和消化系统过程有关。蛋白相互作用分析后找到胰腺癌发生的10个核心基因(ALB、EGF、FN1、COL1A1、COL3A1、ITGA2、COL17A1、CEL
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