【摘 要】
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【目的】研究运用基于高通量测序的技术检测梨树病毒,为梨树病毒的检测提供新方法。【方法】于2014年、2017年、2018年4月中旬采集库尔勒香梨花朵若干,分别进行转录组测序,将
【机 构】
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石河子大学农学院园艺系/特色果蔬栽培生理与种质资源利用兵团重点实验室
【基金项目】
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国家自然科学基金(30360066、31360474),高等学校博士学科点专项科研基金博导类联合课题(2013651810002)
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【目的】研究运用基于高通量测序的技术检测梨树病毒,为梨树病毒的检测提供新方法。【方法】于2014年、2017年、2018年4月中旬采集库尔勒香梨花朵若干,分别进行转录组测序,将得到的序列经过转录本拼接、层次聚类和基因功能注释,筛选出注释为植物病毒的序列作为候选病毒序列。利用RT-PCR方法检测随机采集的香梨枝条样品,验证高通量测序结果的可靠性。【结果】根据3组转录组测序数据的生物信息学分析结果,分别对注释为来源于植物病毒的66、202和921条基因序列进行分析。3种梨树中已报道的病毒,分别是苹果茎痘病毒、
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