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对从国际水稻核心种质库中引进的315份水稻品种的5个穗部性状进行了全基因组关联分析，发现穗长和一次枝粳数受环境影响大，而粒长、粒宽和籽粒长宽比在不同环境下的变化较小.检测到与穗长、一次枝粳数、粒长、粒宽和籽粒长宽比显著关联的标记区域分别有7、5、10、8和6个，其中，粒型相关的11个区域和一次枝粳数相关的1个区域在两个环境中均被检测到.各品种携带的增效等位变异的个数与性状表型值呈显著线性相关.在所有关联位点中，香稻亚群（ARO）和热带粳稻（TRJ）亚群品种平均携带的增效等位变异数最多，最少的为温带粳稻（T