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高等教育是我国经济发展的支撑力量,“中国制造2025”的实现依托的是高等教育人才的培养,高等教育学科结构合理化在很大程度上影响“中国制造2025”目标的进程。通过对2001—2016年各类高校毕业生人数与产业产值数据进行整理,利用因子分析、典型相关分析对高等教育学科结构与新兴产业结构的匹配程度、影响程度进行分析,发现专科学科结构过于笼统、本科管理学、师范学人数居多,出现供给过剩;研究生学科专业与产业发展不显著。解决这一问题,需要优化专科专业设置、重视本科均衡发展、提升研究生人才培养结构与产业发展匹配度。