【摘 要】
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[目的] 髓细胞组织增生蛋白(Myelocytomatosis proteins,MYC)是植物茉莉酸信号转导途径中的重要转录因子.鉴定并分析茶树MYC转录因子有助于了解其潜在的分子机制.[方法] 采用生物信息学方法,对茶树CsMYC转录因子进行全基因组范围内的鉴定与分析.[结果] 从茶树基因组中总共鉴定出9个CsMYC成员,分布在茶树的5条染色体上.系统进化分析表明植物MYC家族可能起源于陆生植物并发生了谱系特异性分化事件.结构分析表明该家族内含子数目为0～3个,说明该家族在进化过程中发生内含子丢失事件
【机 构】
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福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室,福建 福州 350002
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[目的] 髓细胞组织增生蛋白(Myelocytomatosis proteins,MYC)是植物茉莉酸信号转导途径中的重要转录因子.鉴定并分析茶树MYC转录因子有助于了解其潜在的分子机制.[方法] 采用生物信息学方法,对茶树CsMYC转录因子进行全基因组范围内的鉴定与分析.[结果] 从茶树基因组中总共鉴定出9个CsMYC成员,分布在茶树的5条染色体上.系统进化分析表明植物MYC家族可能起源于陆生植物并发生了谱系特异性分化事件.结构分析表明该家族内含子数目为0～3个,说明该家族在进化过程中发生内含子丢失事件.茶树8个MYC成员能在双子叶植物葡萄中找到同源基因.茶树不同组织转录组分析表明,除了CsMYC2和CsMYC9外,其他成员在芽和叶中表达量较高;荧光定量结果表明,所有成员均响应茉莉酸胁迫处理,同时个别成员也响应干旱、低温和赤霉素处理.使用皮尔森相关系数对与CsMYCs各成员表达量显著相关的基因集进行KEGG功能富集分析表明CsMYCs广泛参与了茶树次级代谢相关途径.[结论] 本研究共鉴定出9个CsMYC成员,分析并预测了其结构及潜在分子功能.结合实时荧光定量和功能富集分析表明CsMYC家族在茶树非生物胁迫响应中扮演了重要角色.
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