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天然环境下，匙吻鲟终生以浮游生物为食；在人工养殖情况下，经过7～10天的驯化，可以转食浮性的人工配合饲料。匙吻鲟目前工厂化养殖中采用卤虫、轮虫或小型的枝角类开口，长到3～4厘米转食水蚯蚓，当长到6～10厘米时就可以采用浮性的人工配合饲料进行驯食。采用活饵养殖匙吻鲟不仅会增加成本和劳动强度，而且也难以做到饵料的长期供应，所以从商业化和规模化养殖的角度来看，必须采用人工配合饲料进行养殖。