【摘 要】
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目的:分析高脂饮食对小鼠前列腺组织基因表达芯片数据的生物学网络调控及关键蛋白,为肥胖导致的前列腺癌发生机制提供新的理论依据.方法:从基因芯片公共数据库(GEO)中下载两组C57BL/6J小鼠前列腺组织RNA(正常饮食组5只,高脂肪饮食组4只),利用基因云、基因大数据分析(GCBI)实验平台、GenClip2.0、Sytoscape 3.5.1等分析软件,筛选差异表达基因,探讨差异基因的蛋白交互作用网络和生物学通路,从转录组角度阐述高脂饮食对于前列腺组织基因分子网络改变情况及其可能涉及的分子生物学功能.结果
【机 构】
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咸阳市中心医院泌尿外科,陕西咸阳712000;陕西中医药大学陕西中医药大学公共卫生学院流行病与卫生统计学教研室,陕西咸阳712046;陕西中医药大学基础医学院病理生理学教研室,陕西咸阳712046
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目的:分析高脂饮食对小鼠前列腺组织基因表达芯片数据的生物学网络调控及关键蛋白,为肥胖导致的前列腺癌发生机制提供新的理论依据.方法:从基因芯片公共数据库(GEO)中下载两组C57BL/6J小鼠前列腺组织RNA(正常饮食组5只,高脂肪饮食组4只),利用基因云、基因大数据分析(GCBI)实验平台、GenClip2.0、Sytoscape 3.5.1等分析软件,筛选差异表达基因,探讨差异基因的蛋白交互作用网络和生物学通路,从转录组角度阐述高脂饮食对于前列腺组织基因分子网络改变情况及其可能涉及的分子生物学功能.结果:共筛选出134个差异表达基因,其中上调130个,下调4个,主要涉及染色体组织、细胞-细胞信号传导、小分子生物合成及白细胞激活等生物学功能.基因网络中Lck、Prkcb和Cd28基因Degree值较大,表明其与蛋白质的合成及其生物学功能有很重要的关系,为该蛋白-蛋白网络的核心节点,基Lck和Cd28预测能力较佳.结论:高脂饮食能够诱导前列腺组织基因发生改变,从而导致肿瘤发生.
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目的:探讨捐精志愿者精液细菌分布情况及特点.方法:由于目前无男性精液细菌培养和菌落计数的参考值,依据男性尿路感染诊断标准(尿液细菌培养菌落数＞ 105 cfu/ml应认为有感染,＜104 cfu/ml可能为污染,104cfu/ml～105cfu/ml之间为可疑),重庆市人类精子库将菌落数≥104cfu/ml作为精液细菌培养不合格的界限.对2015年4月至2019年11月到重庆市人类精子库自愿捐精的3160例捐精志愿者的精液样本进行细菌培养,采用英国synbiosis全自动菌落计数仪进行菌落计数,法国梅里埃
目的:基于Cre/LoxP系统建立睾丸Occludin基因敲除小鼠模型,并进一步观察其表型变化差异.方法:使用Cre-LoxP系统构建Occludin-floxed(基因型Floxp/-)小鼠,与AQP2-cre(基因型Cre/-)小鼠进行杂交,得到睾丸内Occludin条件性敲除小鼠(基因型Floxp/Floxp Cre/-.利用PCR及Southern印迹技术鉴定F1代敲除小鼠基因型,利用qPCR,Western印迹以及免疫组化鉴定Occludin敲除小鼠中Occludin蛋白表达来验证Occludi
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