基于S基因序列分析新型猪流行性腹泻病毒的遗传演化

来源 :畜牧兽医学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ytg1987
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最近,笔者实验室在青藏高原地区发现两种新亚型藏猪源猪流行性腹泻病毒(PEDV),为进一步调查新型PEDV是否在四川腹泻猪群中存在或流行,对实验室2018—2019年保存的116份猪腹泻粪便或肠组织样本进行PEDV的检测及其纤突蛋白基因(spike)分子特征研究。结果表明:腹泻样本的PEDV检出率为42.2%(49/116,95%CI=33.1%~51.8%),并获得了13条完整的S基因序列,全长为4149~4170 bp,序列相似性为94.2%~99.9%,其中SWUN-H3-CH-SCYA-2019的S
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