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根据对仙居水资源的调查及对水资源合理配置的研究，提出了仙居水资源合理配置的原则及配置的数学模型，强调仙居水资源应以区域可持续发展思想为指导，以区域水资源综合短缺度最小为目标函数的配置模型，在水资源自然配置格局的基础上，对降水、地表水、地下水、客水、跨流域调水等统筹考虑。同时通过采用不同的权重可对环境生态、工业、农业、生活等不同用水需求区别对待，保证重点，实现水资源的优化配置，较好地处理水资源与社会经济发展和生态环境的关系，使水资源在整体上发挥最大的效益，实现水资源的可持续开发利用。