猪繁殖与呼吸综合征病毒YA株ORF5基因的克隆与序列分析

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以猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)YA株为材料,采用RT-PCR扩增其ORF5基因全长cDNA并进行序列测定和比较分析.结果YA株ORF5基因cDNA编码区长603 bp,可编码200个氨基酸残基.与欧洲型代表株LV株、美洲型代表株VR-2332株在氨基酸水平上的同源性分别为58%和90%,与国内首株分离株(CH-1a)的同源性高达95%,推测YA株属于美洲型.根据YA株ORF5基因编码的氨基酸序列,与具有代表性的12株美洲型毒株和2株欧洲型毒株绘制进化系统树,结果也显示YA株与美洲型分离毒株的遗传关
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