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发展新型研发机构已成为我国深化科技体制改革、完善区域创新体系的迫切需要,创业型大学被赋予了更多创业型职能,逐渐成为建设新型研发机构的主力军.随着创业型大学与新型研发机构建设的逐渐深入,机构布局与定位的碎片化、配套资金与资源获取的约束性及建设成果评价的单一性等深层次问题不断涌现.南京工业大学在新型研发机构建设过程中积累了一些经验,从微观以项目协同开发为核心、中观以机构协同治理为核心、宏观以形成协同生态为核心三个维度,以双轨运行到多维协同的视角针对相关问题的实践逻辑进行了思考,并提出了有效推动科研成果转移转化落地进程、科学布局新型研发机构建设版图、营造新型研发机构激励性监管氛围的对策建议.