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在电能质量监测系统中，数据的高速采集和实时处理的协调一直是实际系统构建的关键问题。在深入分析高速采集和实时处理模式的基础上，分析了各种影响高速采集和实时处理软件实现的因素，在系统的软硬件构建方面综合探索了多种协调优化方法，并以电网谐波实时分析系统的建立为例进行了应用研究。工程实际应用结果表明，优化后的谐波实时分析系统在采样精度、分析电网高次谐波、实时电量存储方面均有较好的实时性，从而为电能质量实时分析系统的设计提供了可供借鉴的方法。