按照协议，川渝双方将建立领导互访机制、协同推进健康中国行动、健全“互联网+医疗健康”服务体系、开展医改经验交流互鉴、推动医疗服务区域合作、加强基层卫生交流合作、健全卫生应急和传染病防控联动机制、加强人才培养和科研合作、建立食品安全标准与风险监测协作机制、深化中医药创新协作、推动健康产业协作发展、加强国际合作交流等。
　　在交流与合作方面，双方将加强两地政策统筹和行动联动。双方将推进健康中国专项行动专家库共建共享，轮流举办健康中国行动川渝合作论坛;重点推进两地肿瘤、心血管病、慢性呼吸系统疾病等大数据协同应用，推动智慧医疗发展。此外，双方支持两地医疗卫生机构、符合条件的第三方机构搭建互联网信息平台;建立川渝远程医疗协作网，为双方患者提供网上咨询、远程会诊等服务，畅通双方转诊绿色通道;推进川渝合作组建跨区域专科联盟和医疗联合体建设，分步骤推进川渝两地二級以上公立医疗机构检验检查结果互认。
　　在重大疫情和突发公共卫生事件联防联控机制方面，川渝也将加强合作。四川省卫健委相关负责人说，双方将在今后建立成渝地区突发公共卫生事件应急防控指挥中心、医疗物资储备中心、演练培训中心，共建国家区域疾病预防治疗中心。不仅如此，建立卫生应急和传染病疫情信息共享机制也体现在合作协议上，两地将对突发急性传染病疫情信息进行通报，实现预警信息及时共享。此外，在人才培养合作机制方面，将共同建立成渝双城卫生人才专家库，推行川渝两地导师带教制度。
　　在川渝健康产业发展方面，支持两地企业投资发展生物医药、医疗器械、休闲养生、医养结合、度假养老等产业。双方将着力推进西部国际医疗城（重庆）、重庆国际生物城、中国牙谷（四川）、天府国际生物城（四川）等产业园区和特色小镇建设，实现区域共赢发展。
　　四川省卫健委有关负责人还表示，川渝两地优势互补，将以卫生健康供给侧结构性改革为主线，促进高质量发展。重点在医疗服务、公共卫生、健康产业等方面进一步加强联动协作。